Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4dQ8BGV9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atg4dQ8BGV9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atg4dQ8BGV9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atg4dQ8BGV9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Atg4dQ8BGV9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atg4dQ8BGV9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atg4dQ8BGV9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atg4dQ8BGV9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atg4dQ8BGV9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg4dQ8BGV9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg4dQ8BGV9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg4dQ8BGV9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg4dQ8BGV9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg4dQ8BGV9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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