Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Htatsf1Q8BGC0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Htatsf1Q8BGC0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Htatsf1Q8BGC0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Htatsf1Q8BGC0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Htatsf1Q8BGC0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Htatsf1Q8BGC0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Htatsf1Q8BGC0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Htatsf1Q8BGC0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms