Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm2Q80W85 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms