Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
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