Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube3cQ80U95 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms