Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1cQ7TSF0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms