Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snd1Q78PY7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms