Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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