Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ssx9Q6XAS3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssx9Q6XAS3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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