Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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