Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Snx13Q6PHS6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Snx13Q6PHS6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms