Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmeff1Q6PFE7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms