Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atl2Q6PA06 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atl2Q6PA06 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atl2Q6PA06 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atl2Q6PA06 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atl2Q6PA06 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atl2Q6PA06 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atl2Q6PA06 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atl2Q6PA06 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atl2Q6PA06 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atl2Q6PA06 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atl2Q6PA06 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atl2Q6PA06 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atl2Q6PA06 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atl2Q6PA06 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.3 ms