Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pkp4Q68FH0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pkp4Q68FH0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pkp4Q68FH0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pkp4Q68FH0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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