Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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