Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc18Q640L5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
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