Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan7Q62283 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan7Q62283 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms