Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Ss18Q62280 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Ss18Q62280 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Ss18Q62280 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Ss18Q62280 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Ss18Q62280 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Ss18Q62280 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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