Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms