Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasa3Q60790 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms