Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms