Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms