Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms