Protein–RNA interactions for Protein: Q571I4

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q571I4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PRAG1Q571I4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PRAG1Q571I4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PRAG1Q571I4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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PRAG1Q571I4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PRAG1Q571I4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PRAG1Q571I4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PRAG1Q571I4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PRAG1Q571I4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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PRAG1Q571I4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAG1Q571I4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms