Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms