Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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