Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rnpc3Q3UZ01 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rnpc3Q3UZ01 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rnpc3Q3UZ01 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnpc3Q3UZ01 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms