Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nom1Q3UFM5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms