Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ssbp4Q3U4B1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ssbp4Q3U4B1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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