Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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