Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd4Q3TT99 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms