Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp39Q3TIX9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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