Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

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Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Col24a1Q30D77 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Col24a1Q30D77 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Col24a1Q30D77 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Col24a1Q30D77 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Col24a1Q30D77 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Col24a1Q30D77 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col24a1Q30D77 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Col24a1Q30D77 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Col24a1Q30D77 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Col24a1Q30D77 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Col24a1Q30D77 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Col24a1Q30D77 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Col24a1Q30D77 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col24a1Q30D77 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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