Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc39dQ0VF76 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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