Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms