Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms