Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Prrx2Q06348 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms