Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aplp2Q06335 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms