Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox10Q04888 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms