Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Nf1Q04690 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Nf1Q04690 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nf1Q04690 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Nf1Q04690 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms