Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scg2Q03517 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms