Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms