Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms