Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax5Q02650 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms