Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms