Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col1a2Q01149 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms