Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms