Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Yy1Q00899 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms