Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Stx2Q00262 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms