Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PgrQ00175 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PgrQ00175 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PgrQ00175 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PgrQ00175 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PgrQ00175 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PgrQ00175 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PgrQ00175 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PgrQ00175 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PgrQ00175 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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PgrQ00175 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PgrQ00175 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PgrQ00175 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgrQ00175 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms